Changes in microbial community structure during pig manure composting and its relationship to the fate of antibiotics and antibiotic resistance genes

YuanwangLiu，DengmiaoChengcJianmingXue，LouiseWeaver，Steve A.Wakelin，YaoFeng，ZhaojunLi

期刊：J Hazard Mater  IF:10.588

作者单位：中国农业科学院 农业资源与区域规划研究所

亮点

•抗生素类型影响堆肥过程中的微生物组成。

•温度和pH值对细菌的组成有进一步的阐述。

•嗜热阶段在减少ARGs，特别是TARGs方面发挥了关键作用。

•qARG和SARG的潜在宿主更受抗生素混合物的影响。

文章摘要

含有兽用抗生素的动物粪便是微生物抗生素抗性基因（ARG）的重要来源。探索了用小麦秸秆和锯末堆肥动物粪便作为减少最终材料中ARG负荷的手段。环丙沙星，土霉素，磺胺嘧啶对细菌群落组成的影响，以及这如何影响七种四环素抗性基因（TARGs），四种磺酰胺抗性基因（SARGs）和两种氟喹诺酮抗性基因（QARGs）的去除。调查。接受环丙沙星或三种混合抗生素的治疗减少了细菌α多样性，并显示了变形杆菌和厚壁菌门丰度的变化。这表明不同的抗生素在细菌群落组成中起重要作用。此外，堆肥物理化学性质的变化，特别是pH和温度，也与细菌组成随时间的变化密切相关。基于网络分析，TARGs的减少与嗜热阶段假单胞菌、假黄单胞菌、Pusilimonas、Aquamicrobium、Ureibacillus、Lysinibacillus、芽孢杆菌和短杆菌的丢失有关。然而，qARG和SARG受多种抗生素存在的影响更大。我们的研究结果对于通过控制堆肥温度，pH值或饲养中使用的抗生素种类来减少某些ARG的传播具有重要意义。

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